國際原子能總署(IAEA) 對於放射性廢棄物管理，揭示多項安全原則，包括「必須建立和保持有效的法律和政府安全框架」、「必須確立和保持對安全的有效領導和管理」、「必須保護當前和今後的人類和環境免於輻射危險」以及「必須實現防護的最適化提供合理可行的最高安全水準」等，作為核能發電國家管制放射性廢棄物的指引。

本會為我國獨立核能安全管制機關，參酌國際原子能總署安全原則，建置安全管制之法規體系，並對放射性廢棄物設施興建執照申請，採取嚴格審查，確認符合法規及技術規範要求，於設施興建期間及運轉期間執行嚴密檢查作業，確保民眾及環境安全。

對於放射性廢棄物設施的設置，本會執照審核制度可分為「設置前」及「運轉前」兩階段進行。設施興建前，本會會先要求經營者（台電公司）應檢附安全分析報告等資料提出興建申請，並將邀請各領域專家學者組成審查團隊嚴格進行審查。同時本會也將申請書件公開展示，並辦理聽證，聽取在地民眾的意見，併同審查團隊之安全審查結果，藉以作成核發興建執照的准駁決定。

設施興建完成後，經營者應提出試運轉計畫並完成試運轉作業，檢附相關安全文件，經本會審核並取得運轉執照後始得運轉。
 
為確保設施之運轉安全，本會於放射性廢棄物處理或貯存設施運轉後，會定期與不定期派員赴各設施執行安全檢查，並就檢查所發現之缺失，要求設施經營者進行改善。此外，要求放射性廢棄物設施定期進行安全狀況再評估，以確保放射性廢棄物貯存安全。

另於設施運轉期間，本會亦要求定期進行各項意外事故演練，以因應各種可能的異常情況，並確保民眾的輻射安全。