本會對於各項輻射作業皆有嚴格的管制，相關作業區域需管制進出，並且視其輻射作業性質及曝露程度，訂定相關輻射監測措施。以核電廠為例，管制區內會有門禁管控和物品進出管制，防止放射性污染；管制區外，劃定為監測區，配置輻射偵檢儀器，執行必要的輻射監測。此外，對於廠外環境，也會依照規定進行環境採樣分析，確保其作業為對周遭環境不致造成不良影響，相關監測結果亦公開查閱。
 

此外，對於輻射強度較高的高強度輻射設施及放射性物質生產製造設施，如放射醫療使用之質子治療設備、重粒子治療設備、核醫藥物生產設施、學術研究用使用之同步輻射加速器、輻射照射廠等，本會也採取「跨領域專業審查、高頻次現場檢查及多階段許可」的管制方式，經過申請、安裝、試運轉及使用等四個階段審查及檢查合格後，才發給使用許可證，確保設施安全運作，以保障環境及人員輻射安全。
 
為確保我國環境輻射，本會輻射偵測中心也建置了全台共63座即時環境輻射監測站，提供即時環境輻射監測數據，民眾可隨時至本會官網查詢所在區域的環境輻射數值。